На портрете кисти Ральфа Хейманса королева изображена в церемониальном платье, включая государственную мантию.
Он был написан в прошлом году к празднованию бриллиантового юбилея королевы.
Всего девять дней назад Елизавета II и другие члены королевской семьи присутствовали на специальной службе в аббатстве в ознаменование 60-летия со дня ее коронации.
"В четверг около полудня неизвестный посетитель аббатства обрызгал краской портрет королевы работы Ральфа Хейманса, который выставлен в часовне, - заявил представитель Вестминстерского аббатства. - Пока мы не проведем реставрационные работы, к сожалению, нам придется приостановить доступ публики к портрету".
Представители Букингемского дворца сообщили, что никаких комментариев по поводу произошедшего не будет.
Задержанный подозреваемый находится в одном из полицейских участков в центре Лондона, сообщили в столичной полиции.
"Это не была официальная акция протеста "Отцов за справедливость", но ее осуществил один из членов нашей организации. В воскресенье отмечается День отца – для нас это очень эмоциональное время, и эта акция явилась отчаянной мольбой о помощи", - говорится в заявлении движения.
Наиболее громкие акции "Отцов за справедливость" пришлись на 2004-2005 годы. Активисты организации бросали пакеты с мукой в тогдашнего премьер-министра Тони Блэра в зале заседаний парламента и взбирались на здания государственных учреждений, в частности того же парламента и МИДа, в костюмах супергероев.
Портрет под названием "На месте коронации, Вестминстерское аббатство: портрет Ее Величества королевы Елизаветы II" имеет размеры 275 см на 330 см.
В марте прошлого года в Букингемском дворце королева специально позировала для живущего в Лондоне австралийского художника Ральфа Хейманса.
Впервые портрет был представлен публике в 2012 году в рамках празднования Бриллиантового юбилея, а до марта этого года он был выставлен в Национальной портретной галерее в Канберре в Австралии.
На сайте Вестминстерского аббатства есть описание портрета, согласно которому королева изображена художником в минуту раздумья вечером.
Елизавета II на портрете одета в алую государственную мантию, которая была на ней в момент коронации 2 июня 1953 года.