Фото: Reuters
Ослабленная ВИЧ имунная система африканцев способствовала мутации одного из штаммов сальмонеллы
Атипичный штамм сальмонеллы, заражение которой приводит к смертельному исходу у половины больных, появился в Африке благодаря беспрепятственной эволюции этого патогена в крови людей, зараженных вирусом иммунодефицита человека.
Как отметил один из авторов исследования Чинере Окоро из
Института Сангера в Хинкстоне (Великобритания), уязвимость иммунной системы,
пораженной ВИЧ, а также малярия и недостаток пищи, позволила бактериям
проникнуть, адаптироваться, распространиться и мутировать.
Группа биологов под руководством Гордона Дугана (Gordon
Dougan) из Института Сангера пыталась найти источник крайне необычной эпидемии
сальмонеллеза (iNTS) в Африке, изучая геном сальмонелл (Salmonella enterica),
извлеченных из кишечника погибших жителей Кении, Малави и других африканских
стран.
Дуган и его коллеги секвенировали геномы более 120 штаммов
сальмонеллы, сравнили их и подготовили "генеалогическое древо",
описывающее родственные связи между различными культурами бактерий.
Оказалось, что все штаммы атипичной сальмонеллы делятся на
две группы, которые ученые обозначили как "линия 1" и "линия
2". Геном этих бактерий заметно отличается от устройства ДНК
"обычных" штаммов сальмонеллы из серовара Typhimurium, в состав
которого они входят.
К примеру, геномы обычной и атипичной сальмонеллы отличаются
друг от друга на 700 мутаций, тогда как максимальное число различий между
бактериями из разных линий не превышает 450.
Ученые наложили полученное генеалогическое древо на карту
Африки и определили время зарождения и местоположение источника
"родительских" штаммов iNTS. Оказалось, что "линия 1"
возникла примерно 50 лет назад в Малави, в районах, которые связываются с
началом первых эпидемий СПИДа в Африке. Затем эта группа iNTS проникла в Кению,
Демократическую Республику Конго, Уганду и Мозамбик.
Вторая линия возникла значительно позже - в 1977 году в
Демократической Республике Конго. Она распространилась по тем же странам
тропической Африки примерно по тем же маршрутам, что и "линия 1", но успела
проникнуть дальше - в Нигерию, Мали и некоторые другие северные страны.
Начиная с 2003 года, эта линия начинает стремительно
вытеснять бактерий из первой группы, так как бациллы из "линии 1" не
были устойчивы к хлорамфениколу - антибиотику, при помощи которого врачи
пытались спасти жертв сальмонеллы.
Место зарождения этих бактерий и траектория их
распространения во многом совпадает с тем, как расширялись масштабы эпидемии
ВИЧ в Африке. Это позволило ученым предположить, что этот подвид сальмонелл развился
в популяции носителей ВИЧ в странах центральной и восточной Африки.
Пока остается не понятным, как распространяются эти бактерии
и как они заражают здоровых людей. Ученые планируют найти ответ на эти вопросы,
продолжив изучение генома сальмонеллы.
Напомним, в сентябре текущего года жертвами вспышки геморрагической лихорадки Эбола на северо-востоке Демократической республики Конго стали 15 человек. Как сообщается, в настоящее
время около 170 контактировавших с инфицированными находятся под
наблюдением врачей, выявлено 28 случаев заболевания, восемь из которых
подтверждены лабораторно.